Product Articles

Life Science

การบ่งชี้ชนิดของ human cell lines โดยวิธี STR DNA profiling analysis

          HeLa cells เป็น human cell line ชนิดแรกที่ถูกค้นพบ โดยประโยชน์ของการใช้ cell line ในงานวิจัยคือ สามารถใช้เป็นโมเดลในการศึกษาโรคในมนุษย์ เช่น โรคมะเร็ง หรือ ใช้เพื่อเพิ่มจำนวนไวรัสสำหรับการผลิตวัคซีน รวมถึงใช้ในการผลิต recombinant proteins เพื่อใช้ในการรักษาโรค เป็นต้น อย่างไรก็ตามในปัจจุบันมีความก้าวหน้าในงานวิจัยที่เพิ่มมากขึ้นทำให้มี cell line หลากหลายชนิดที่ใช้ในงานวิจัย ซึ่งการใช้ cell line ในการทดลองหรือการทำวิจัยนั้น อาจเกิดความผิดพลาดที่ทำให้เกิดการ cross-contamination ของเซลล์ได้ ซึ่งอาจนำไปสู่ผลการทดลองที่ผิดพลาด จึงเป็นที่มาของเทคนิค Short Tandem Repeat (STR) DNA profiling ที่สามารถใช้ในการตรวจสอบชนิดของ cell line เพื่อช่วยในการตรวจสอบในกรณีที่เกิดการ cross-contamination หรือ ผู้วิจัยต้องการยืนยันความถูกต้องของชนิด cell line ที่ใช้ในการทดลอง

 

          เทคนิค Short Tandem Repeat (STR) DNA profiling อาศัยแบบแผนของ DNA ของส่วน DNA ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ซ้ำๆ กัน 1-6 นิวคลีโอไทด์ในการตรวจสอบความถูกต้องของ cell line โดย cell line แต่ละชนิดจะมีชนิดของ STR marker และจำนวนของ STR marker ในการตรวจสอบแตกต่างกัน ซึ่งผลการวิเคราะห์ STR profile ที่ได้จะนำไปเปรียบเทียบกับ reference (รูปที่ 1) แล้วคำนวณผลออกมาเป็นเปอร์เซ็นต์ความเหมือน

 

https://www.pinterest.com/pin/451415562652827620/

รูปที่ 1 ตัวอย่าง STR marker ที่เป็น homozygous และ heterozygous

          บริการการบ่งชี้ชนิดของ human cell lines โดยวิธี STR DNA profiling analysis เป็นบริการภายใต้บริษัท Macrogen ซึ่งขั้นตอนในการตรวจ STR DNA profiling analysis มีดังนี้

1. สกัด DNA ของ cell line

2. PCR

3. Sequencing

4. STR analysis

การแปลผล

1. ถ้าเปอร์เซ็นต์ความเหมือนกันที่ได้อยู่ในช่วง 0 - 55% แสดงว่า ตัวอย่างไม่มีความสัมพันธ์กัน (different donors)

2. ถ้าเปอร์เซ็นต์ความเหมือนกันที่ได้อยู่ในช่วง 56 - 79% แสดงว่า ผลการทดสอบไม่แน่นอน ต้องอาศัยการทดสอบอื่น ๆ เพิ่มเติม

3. ถ้าเปอร์เซ็นต์ความเหมือนกันที่ได้อยู่ในช่วง 80 - 100% แสดงว่า ตัวอย่างมีความสัมพันธ์กัน (same donor)

บทความโดย:กัลยารัตน์ แก้วนิรัตน์

ตำแหน่ง:Technical application specialist (TAS)

ตัวอย่าง Report: /userfiles/files/Cell_line%20STR%20analysis%20report_21marker.pdf

สำหรับข้อมูลของการให้บริการสามารถติดต่อขอข้อมูลได้ที่อีเมล์ macrogenpm@gibthai.com


X