LUX primer

         LUX primer (Light Upon eXtension) คือไพรเมอร์ที่ใช้ในงาน real time PCR (qPCR) ซึ่งเป็นการรวมเทคโนโลยีการ chemistry detection ของ real time PCR แบบ probe และ sybr green base detection มาไว้คู่กัน ซึ่งให้ความไว (sensitivity) ความจำเพาะ (specificity) เทียบเท่ากับการใช้ probe detection (ตารางที่ 2) ซึ่งใช้ทำได้ทั้ง qPCR และ qRT-PCR โดยจะไพรเมอร์จะมีการออกแบบมาอย่างจำเพาะกับเส้นดีเอ็นเอเป้าหมาย และทำการติดสีด้วย FAM, Alexa fluor หรือ JOE อย่างใดอย่างหนึ่ง ทั้งนี้ invitrogen เองยังมี LUX primer หลายๆ เช่น Certified LUX assay เป็น LUX primer ที่มีการออกแบบมาแล้วสำหรับยีนนั้น และผ่าน validated function มาแล้วว่าใช้งานได้จริง เช่นยีนในมนุษย์ และเชื้อโรคต่างๆที่ต้องการตรวจ ทั้งนี้เรายังมีการรับออกแบบ LUX primer ผ่าน online tool ด้วย ดังตารางที่1 ซึ่งข้อได้เปรียบและข้อดีข้อ LUX primer คือ 

          -  มี dynamic range ของการ detection ได้ตั้งแต่ copies ต่ำๆหรือ 10-108 นาดโมเลกุล 
          -  สามารถทำ melting curve analysis ได้เหมือนการใช้ sybr green detection ในขณะที่การใช้ taqMan probe ทำไม่ได้ 
          -  ใช้กับเครื่อง real time PCR ได้ทุกยี่ห้อ ทุกรุ่น
          -  สามารถทำ multiplex real time PCR ได้

 ตารางที่ 1: แสดง LUX primer ต่างๆ  :

 

Assay design

validation

Species

Dye labels

   Certified LUX 

   Pre-designed

   Functional

   Infectious disease
   Multiple species

   FAM, JOE

   D-LUX select gene expression

   Pre-designed

   In silico

   Human, Mouse, Rat

FAM, JOE, Alexa fluor

   Custom D-LUX

   Customer design

 

   Any

FAM, JOE, Alexa fluor

   D-LUX design and validate function

   Design by invitrogen sciencetist

   Functional

   Any

FAM, JOE, Alexa fluor

 LUX primer ทำงานอย่างไร
 LUX primer จะเป็นไพรเมอร์ 2 เส้นเหมือนการทำงาน PCR ทั่วๆไป คือมีเส้น Forward และ reverse แต่จะมีเส้นใดเส้นหนึ่งถูกติดสีด้วยสี fluorescence (FAM, JOE, Alexaflour) ที่ปลาย 3'End โดยจะอยู่ในโครงสร้าง hair pin structure ซึ่งสีจะยังไม่มีการเปล่งสีใดๆออกมา แต่เมื่อไพรเมอร์เข้าไปจับกับดีเอ็นเอเป้าหมาย สี fluorescence จะถูกกระตุ้นให้มีการเปล่งสีออกมาทันที ดังรูปที่ 1 ทำให้ LUX primer มีความจำเพาะมากกว่าการใช้สี sybr green ธรรมดา

รูปที่ 1: แสดงการทำงานของ LUX primer และแสดงลักษณะการทำงานเมื่อเทียบกับ TaqMan®





ตารางที่ 2: แสดงการเปรียบเทียบประสิทธิภาพการของ detection platform ต่างๆ 
 
                                                                                                           

More information please visit :  www.invitrogen.com/lux

 

ContactGibthai
Copyrights © 2015 & Gibthai Co., Ltd. All Rights Reserved
Privacy Policy |   Terms of Service