Production Information Technical Note
FAQs Literature&Brochure
Promotion New&Highlights
 
Customer Request !!
Sample Offer
Technical note
FAQs
Catalog & Brochure
E-Catalogs






 

FAQs




 
TOPO cloning  | alamarBlue New!!  | CountessTM  | siRNA  | EASIA  | TriZol reagent  | E.coli  | SYBR safe  | Gateway technology  | magnetic beads  | BIOSTAT Bplus  | Fetal Bovine Serum  | Primer  | SuperScript RT  | PCR  | T7 expression system  | transfection reagent  | real-time PCR  | Qubit fluorometer  

Question of Primer

ความยาวสูงสุดของ Primer ที่สามารถสั่งสังเคราะห์ได้

100 เบส

 
กระบวนการในการสังเคราะห์ Primer เป็นอย่างไร

GIBCO BRL สังเคราะห์ Primer โดยใช้วิธี Standard B Cyanoethyl Phosphoramidite Chemistry ซึ่งจะมี Coupling Efficiency 97 ถึง 99 % ต่อเบส

 
ในการสังเคราะห์ Oligonucleotide แต่ละครั้งได้ผ่านการควบคุมคุณภาพอย่างไรบ้าง

จะมีการตรวจตามค่า Coupling Efficiency โดยใช้วิธี Trityl Analysis ค่า Coupling Efficiency ต่ำสุด โดยเฉลี่ยจะต้องมากกว่า 97 % ถ้าพบว่ามีขั้นตอนใดของ Coupling มีค่าน้อยกว่า 95 % จะต้องนำ Oligonucleotide สายนั้นไป ตรวจสอบด้วยวิธี Capilary Electrophoresis เพื่อให้มั่น ใจได้ว่า Oligonucleotide สายนั้น มีความยาวครบตามต้องการ

 
ใช้เวลาในการสั่ง Primer นานเท่าใด

กรณีเป็น Standard Unmodified Primer ที่มีความยาวน้อยกว่า 30 เบส จะสามารถ ส่งสินค้า ได้ภายใน 7 วัน ทำการ กรณีที่สั่ง 1 umole Scale, 5’ Modified และ Phosphorothioate Primer จะส่งสินค้า ได้ภายใน 12 วัน ทำการ กรณีที่สั่ง HPLC และ Primer จะส่งสินค้าได้ภายใน 15 วันทำการ

 
Custom Primers ที่สังเคราะห์ แล้วบรรจุและขนส่งอย่างไร

Custom Primers จะอยู่ในรูป Lyophilized และขนส่งที่อุณหภูมิห้อง บรรจุอยู่ในหลอดพลาสติก Polypropylene ฝาเกลียวขนาด 2 มิลลิลิตร หรือ 96 – well Polypropylene dish กรณีที่สั่งเป็น ปริมาณมาก

 
จำเป็นที่จะต้อง Desalt Oligonucleotide หรือไม่

ขึ้นอยู่กับจุดประสงค์ในการใช้งานของ Primer นั้นๆ Desalt ไม่จำเป็นสำหรับงาน PCR, Cycle sequencing และ Hybridization แต่จะจำเป็นต้อง desalt เมื่อทำงาน Standard dideoxy sequencing และ in vitro mutagenesis รวมทั้ง modification ต่าง เช่น5’ fluoxscein, 5’ rhodamine, 5’HEX, TET และ 5’ 6- FAM จำเป็นที่จะต้องทำ desalt เช่นกัน

 
การทำ Desalt ทำอย่างไร

จะใช้ C18 reverse phase chromatography column ในการกำจัด Isobutryl และ Benzoyl Group ที่ถูกสร้างขึ้นมาระหว่างการทำ Deprotection

 
ควรจะเลือกสั่งสังเคราะห์ scale เท่าใด ระหว่าง 50 nmole หรือ 200 nmole

50 nmole scale จะได้ yield อยู่ระหว่าง 2 ถึง 5 O.D Units ในขณะที่ 200 nmole scale จะได้ yield มากกว่า 10 O.D Units Yield ที่ได้ขึ้นอยู่กับขนาดของ Oligonucleotide, Coupling efficiency และ G C Content โดย Primer ที่มี 50 nmole scale จะสามารถนำไปทำ PCR ได้ 1000 ถึง 5000 ครั้ง ( 100 m l ต่อ Reaction โดยใช้ Primer ที่ 0.1 ถึง 0.5 m M)