Invitrogen GeneArt Directed Evolution services เป็นบริการที่ครอบคลุมการสร้าง genetic variants ของสิ่งมีชีวิต ตั้งแต่การเปลี่ยนแปลงสารพันธุกรรมแบบ single–base pair จนถึงการสังเคราะห์ libraries แบบเต็มรูปแบบ นอกจากนี้ยังมีทางเลือกสำหรับนักวิจัยที่ต้องการสร้าง genetic diversity และสมบัติของโปรตีนได้ตามต้องการ เพื่อสร้างชีวโมเลกุลเพื่อใช้ในด้านต่างๆ อันครอบคลุมตั้งแต่การผลิตภาคอุตสาหกรรม วิทยาศาสตร์การแพทย์ และการวิจัยขั้นพื้นฐาน

รูปที่ 1 Invitrogen GeneArt Directed Evolution services

จุดเด่นของ GeneArt Directed Evolution services

• ไม่จำเป็นต้องมี physical template

• สามารถสร้าง DNA ที่มีความหลากหลายได้ โดยไม่ต้องใช้ conventional methods

• มีความสามารถในการสร้างความหลากหลายได้มากตามต้องการ โดยความสมบูรณืของลำดับ DNA ยังคงอยู่ และก่อให้เกิดการ mutation

• ช่วยลดการคัดกรองความหลากหลายของ DNA ได้อย่างมีนัยสำคัญ เมือเทียบกับการใช้ conventional mutagenesis methods

• ใช้ next- generation sequencing ในการทำ quality control

รูปที่ 2 Application ที่สามารถใช้ Invitrogen GeneArt Directed Evolution services ได้

Featured GeneArt Directed Evolution services

- GeneArt Combinatorial Libraries: เป็นการสังเคราะห์ libraries ด้วย TRIM technology (optional) สำหรับ random variation ในรูปแบบ multiple codons (up to 1012 variants) จะมีการปรับแต่งองค์ประกอบ amino acid อย่างสมบูรณ์

รูปที่ 3 GeneArt Combinatorial Libraries

- GeneArt Controlled Randomization Service: เทคโนโลยีขั้นสูงที่แนะนำสำหรับการทำ random mutations ที่มีความถี่ของ DNA ที่ผู้วิจัยต้องการบนยีนที่ถูกระบุ ทำให้เกิดการกลายพันธุ์ของ ORF ทั้งหมด หรือจำกัด variation ตามตำแหน่งที่เลือก (up to1011 variants)

- GeneArt Strings Libraries: เป็นบริการที่รวกเร็วและราคาย่อมเยา เนื่องจากเป็นการสังเคราะห์ DNA แบบ pool GeneArt Strings DNA Fragments ได้ตั้งแต่ขนาด 200-2,000 bp ที่มีสูงสุดถึง 3 blocks ของ 30 degenerate nucleotides โดยจะมีการกระจายตัวของ DNA แบบสุ่ม (full IUPAC code)

รูปที่ 4 GeneArt Controlled Randomization Service

- GeneArt Mutagenesis Service: เป็นการทำ site-directed mutagenesis ในราคาประหยัดและรวดเร็วของ DNA templates ที่มีอยู่ด้วยการทำ PCR

- GeneArt Site-Saturation Mutagenesis: เป็นการทำ Systematic mutagenesis เพื่อแทนที่ wild type codon ที่ตำแหน่งจำเพาะด้วย codons สูงสุดถึง 19 non–wild type amino acids ที่มีตัวเลือกมากมายเพื่อให้เหมาะกับความต้องการของผู้วิจัย

รูปที่ 5 GeneArt Site-Saturation Mutagenesis

         โดยทั่วไปแล้ว Conventional mutagenesis protocols อาศัยการกลายพันธุ์ random mutations แทบทั้งหมด อย่างไรก็ตามสิ่งที่น่ากังวลมากขึ้นก็คือ สามารถสร้างตัวแปรลำดับที่เป็นไปได้เพียงเล็กน้อยเท่านั้น ดังนั้นการค้นหาตัวแปรที่ดีที่สุดจึงไม่น่าเป็นไปได้อย่างยิ่ง แต่หากท่านต้องการความหลากหลายของ DNA ที่ผ่านการทำ variant Mutagenesis ในตำแหน่งที่ตรงกับความต้องการ และไม่ต้องเสียเวลาในการ screening “GeneArt Directed Evolution services” เป็นทางเลือกที่ดีที่สุดสำหรับงานวิจัยของท่าน

ข้อมูลเพิ่มเติม: https://www.thermofisher.com/th/en/home/life-science/cloning/gene-synthesis/directed-evolution.html

หรือติดต่อแผนก Technical support e-mail: TAS@3nholding.com หรือฝ่ายงาน Life Science product โทร 022748331

บทความโดย: ชุตินธร ช่วยวงศ์

ตำแหน่ง:Senior Technical Application Specialist for NGS and GeneArt Products