เทคโนโลยี OpenArray™ บนการทำงานของ
เครื่อง QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System

        Applied Biosystems™ OpenArray™ เป็นเทคโนโลยีที่ช่วยในการศึกษา Gene expression และ Genotyping ที่มีจำนวนยีนเป้าหมายตั้งแต่ 1 - 12,000 ภายในครั้งเดียว ซึ่งรูปแบบของ OpenArray จะเป็นลักษณะแบบเพลต (Plate) สามารถกำหนดยีนเป้าหมายได้หลากหลายตามลักษณะของงานวิจัยที่ต้องการศึกษา

      OpenArray™ plates ถูกออกแบบและพัฒนามาให้ใช้งานง่าย โดยสามารถเติมตัวอย่างและน้ำยาทดสอบด้วยเครื่อง Applied Biosystems™ QuantStudio™ 12K Flex OpenArray™ AccuFill™ System ซึ่งเป็นระบบอัตโนมัติ ทำให้แต่ละช่องจะมี 33 nL ต่อหนึ่งช่องปฏิกิริยและนำเพลตมาทำปฏิกิริยาบนเครื่อง QuantStudio 12K Flex system (ภาพที่ 1) จะเห็นได้ว่าใช้น้ำยาทดสอบและตัวอย่างน้อยมาก และยังช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการตรวจหายีนเป้าหมายอีกด้วย
             

              OpenArray Plates                                   QuantStudio™ 12K Flex Accufill                          QuantStudio 12K Flex system

ภาพที่ 1 : เครื่องมือสำหรับการใช้ OpenArray™ บนการทำงานของเครื่อง QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System

ที่มา : OpenArray Plates (Custom หรือ fixed-content panels)
           QuantStudio™ 12K Flex Accufill System (Catalog number: 4471021)
           QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System, OpenArray™ block, desktop
           (Catalog number: 4472380)

           เทคโนโลยี OpenArray™ จะใช้แผ่นสไลด์ที่มีจำนวน 3,072 Microscope แต่ละแผ่นจะมี 48 Subarrays และมีหลุมปฏิกิริยาย่อย 64 หลุมในแต่ละอัน มีเส้นผ่านศูนย์กลาง 300 μm ความลึก 300 μm เคลือบด้วยสาร Hydrophilic และ Hydrophobic ซึ่ง OpenArray 1 เพลท เทียบเท่ากับการรันด้วยแพลตฟอร์ม 384 well ถึง 8 เพลท

ภาพที่ 2 : แสดงลักษณะของ OpenArray plate anatomy
ที่มา : https://www.thermofisher.com/th/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-openarray/open-array-technology.ht

                                A.                                                           B                                                    C                                                   D                                                         E

      Select assays or panels             Add samples & master mix                  Load samples                           Apply lid & fill                    Cycle, image, analyze data

ภาพที่ 3 OpenArray™ workflow on the QuantStudio 12K Flex Real-Time PCR System

  A: เลือก Predesigned หรือ Custom OpenArray plates ได้ที่ thermofisher.com/openarray
  B: นำตัวอย่าง cDNA/DNA template และน้ำยาทดสอบ (Master mix) ผสมลงใน 384-well plates
  C: นำ 384-well sample plates ใส่เครื่อง QuantStudio 12K Flex AccuFill System
  D: เติมตัวอย่างลงใน OpenArray plate
  E: สั่งการทำงานและดูผลทดสอบผ่านเครื่อง QuantStudio 12K Flex instrument
ที่มา : OpenArray workflow overview with the QuantStudio 12K Flex System

          การประยุกต์ใช้เทคโนโลยี OpenArray™ ร่วมกับ TaqMan Assays จะช่วยให้ความหลากหลายของการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับงานทางด้านพันธุกรรมกว้างยิ่งขึ้น เช่น การศึกษา SNP genotyping, Gene Expression, microRNA analysis และงานด้าน Pharmacogenomics เป็นต้น

ข้อมูลเพิ่มเติม : https://www.thermofisher.com/th/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-openarray.html
หรือติดต่อแผนก Technical support e-mail: TAS@3nholding.com หรือฝ่ายงาน Life Science product โทร 02-274-8331

บทความโดย: สุมิตรา สุขพิทักษ์
ตำแหน่ง: Technical Application Specialist