ชุดน้ำยาและไลบรารีสำหรับการจำแนกชนิดจุลินทรีย์
(Microbial Identification Kits and Libraries)

     ชุดน้ำยาและไลบรารีสำหรับการจำแนกชนิดจุลินทรีย์ (Microbial Identification Kits and Libraries) ภายใต้แบรนด์ Applied Biosystems™ สามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการการตรวจสอบและระบุสายพันธุ์ของเชื้อจุลชีพได้อย่างแม่นยำ เพื่อใช้ในงานควบคุมคุณภาพหรือตรวจสอบการปนเปื้อนเชื้อจุลชีพหรือแบคทีเรีย ซึ่งมีชุดน้ำยาให้เลือกใช้ตามลักษณะงานหรือตามชนิดของจุลชีพที่สนใจ เช่น แบคทีเรีย (Bacterial), รา (Fungal) และยีสต์ (Yeast) โดยชุดน้ำยาที่ใช้ทดสอบจะประกอบไปด้วยชุด MicroSEQ PCR และ Sequencing Kits ซึ่งจำเพาะต่อการทดสอบและใช้งานบนเครื่อง SeqStudio™ Series Genetic Analyzers ช่วยให้ผลการทดสอบมีความน่าเชื่อถือและสามารถทดสอบซ้ำได้

ภาพที่ 1 เครื่อง SeqStudio Genetic Analyzer

ชุดทดสอบ Bacterial ID kits และ Libraries

     การระบุชนิดของแบคทีเรีย (Microbial Identification) จะใช้ลำดับยีน 16S ribosomal RNA (rRNA) ซึ่งเป็นยีนที่พบได้โดยทั่วไปในแบคทีเรีย และสามารถใช้ศึกษาเกี่ยวกับความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมได้ โดยยีน 16S rRNA นี้มีความยาว 1,500 bp ประกอบไปด้วย 9 บริเวณที่มีการแปรผัน (Variable regions) ส่วนบริเวณที่อนุรักษ์ (Conserved regions) จะมีความคล้ายกันในเชื้อจุลชีพทุกชนิด (Micro-organisms) ดังภาพที่ 1 ยกตัวอย่าง เช่น ชุดทดสอบ MicroSEQ™ Full Gene 16S rDNA PCR Kit ได้รับการออกแบบเพื่อใช้ในขั้นตอนการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมด้วยเทคนิค PCR จากนั้นใช้ชุด MicroSEQ™ Full Gene 16S rDNA Sequencing Kit เพื่อใช้ในขั้นตอน Sequencing เพื่อระบุสายพันธุ์และระบุชนิดของแบคทีเรียโดยใช้งานร่วมกับ MicroSEQ ID 16S rDNA Full Gene Library v2.1 นอกจาก Bacterial ID kits และ Libraries ข้างต้นแล้ว ในการระบุเชื้อจุลชีพโดยใช้ยีน 16S rRNA ผู้ใช้งานยังสามารถเลือกใช้ชุดทดสอบ16S rRNA ที่อยู่บริเวณ 500 bp แรก โดยจะมีการออกแบบที่ครอบคลุมบริเวณที่มีความแปรผันของยีน 3 จาก 9 บริเวณ และเพื่อเพิ่มความแม่นยำในการระบุสายพันธุ์จึงมีความจำเป็นต้องเลือกใช้ประเภทของฐานข้อมูล (Libraries) ให้ตรงกับประเภทของ Bacterial ID kits นั้นๆ ดังตารางที่ 1

ภาพที่ 2 บริเวณที่มีการแปรผัน 9 ตำแหน่ง (variable regions) ในยีน 16S ของจุลชีพ (สีเขียว) บริเวณส่วนที่อนุรักษ์ (conserved regions) จะแสดงเป็นสีเทา

ตารางที่ 1 แสดงชุดทดสอบ Microbial Identification Kits และ Libraries

     ชุดทดสอบ Microbial Identification Kits เป็นน้ำยาที่อยู่ภายใต้กลุ่มสินค้า MicroSEQ™ Kits ซึ่งจะประกอบไปด้วย PCR Kits และ Sequencing Kits ของเชื้อจุลชีพที่ต้องการศึกษาหลายชนิด โดยเมื่อนำผลมาวิเคราะห์ร่วมกับซอฟแวร์ MicroSEQ™ ID Analysis Software จะทำให้ได้ผลทดสอบที่แม่นยำในการระบุสายพันธุ์ จึงทำให้ห้องปฏิบัติการสามารถแปรผลได้ง่าย สะดวก และรวดเร็ว

ภาพที่ 3 องค์ประกอบในหนึ่งชุดทดสอบของ MicroSEQ™ Kits

ข้อมูลเพิ่มเติม : https://www.thermofisher.com/th/en/home/life-science/bioproduction/contaminant-and-impurity-testing/microbial-identification/kits-libraries.html
หรือติดต่อแผนก Technical Support e-mail: TAS@3nholding.com หรือฝ่ายงาน Life Science Product โทร 02-274-8331

บทความโดย: สุมิตรา สุขพิทักษ์
ตำแหน่ง: Technical Application Specialist