Product Articles

Life Science

การเลือกแผ่นใช้เมมเบรนสำหรับงาน Western Blotting

การเลือกแผ่นใช้เมมเบรนสำหรับงาน Western Blotting

  หลังจากแยกโปรตีนด้วยกระบวนการ SDS-PAGE ขั้นตอนสำคัญถัดไปในการทำ Western Blotting คือการถ่ายโอนโปรตีนลงบนเมมเบรน (Protein Transfer) เพื่อเตรียมพร้อมสำหรับการตรวจจับด้วยแอนติบอดี โปรตีนที่ถูกแยกตามขนาดจะถูกดึงออกจากเจลด้วยสนามไฟฟ้าและเคลื่อนที่ไปจับบนเมมเบรน ซึ่งทำหน้าที่เป็นพื้นผิวสำหรับยึดโปรตีน ขั้นตอนนี้มีผลโดยตรงต่อคุณภาพสัญญาณ ความคมชัดของแถบโปรตีน และความไวในการตรวจจับ ดังนั้น การเลือกประเภทเมมเบรนที่เหมาะสมจึงเป็นปัจจัยสำคัญต่อประสิทธิภาพของการถ่ายโอนโปรตีน

ชนิดของเมมเบรนที่ใช้ในเทคนิค Western Blotting

  ในเทคนิค Western blotting สามารถเลือกใช้เมมเบรนได้หลากหลายประเภท เช่น Nitrocellulose, PVDF, Nylon, Cellulose acetate และ Polyethersulfone (PES) โดยแต่ละชนิดมีคุณสมบัติ ข้อดี และการใช้งานที่แตกต่างกัน อย่างไรก็ตาม เมมเบรนที่ได้รับความนิยมและใช้กันอย่างแพร่หลายที่สุดคือ Nitrocellulose และ PVDF เนื่องจากให้ความไวสูง ยึดโปรตีนได้ดี และเหมาะสมกับการตรวจจับโปรตีนในช่วงความเข้มข้นต่าง ๆเมมเบรนไนโตรเซลลูโลส (Nitrocellulose membranes)
Nitrocellulose Membrane: เมมเบรนไนโตรเซลลูโลสเป็นเมมเบรนที่ใช้กันอย่างแพร่หลายที่สุดในงาน Western blotting เนื่องจากมีคุณสมบัติที่เหมาะสมกับการตรวจจับโปรตีนหลากหลายชนิด จุดเด่นของเมมเบรนชนิดนี้ ได้แก่
    • สามารถใช้งานได้กับโปรตีนหลายช่วงขนาด
    • ไม่จำเป็นต้องทำขั้นตอน pre-wetting ก่อนใช้งาน
    • ให้สัญญาณพื้นหลังต่ำ (low background)
    • มีราคาค่อนข้างประหยัด

    ผู้ใช้สามารถเลือกขนาดรูพรุนของเมมเบรน (0.1–0.45 ไมโครเมตร) เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพการถ่ายโอนโปรตีนและความคมชัดของแถบโปรตีน อย่างไรก็ตาม เมมเบรนไนโตรเซลลูโลสมีความเปราะและฉีกขาดได้ง่าย จึงไม่เหมาะสำหรับการทำ Stripping และ Reprobing หลายรอบ

ภาพที่ 1 Nitrocellulose membrane

PVDF (Polyvinylidene Fluoride) Membrane: เมมเบรน PVDF เป็นอีกหนึ่งตัวเลือกยอดนิยมสำหรับงาน Western blotting ที่ต้องการความทนทานและประสิทธิภาพสูง มีคุณสมบัติเด่นดังนี้
    • เหมาะสำหรับการตรวจจับโปรตีนหลากหลายชนิด
    • มีความสามารถในการยึดจับโปรตีนสูงกว่าเมมเบรนไนโตรเซลลูโลส
    • มีความเสถียรและทนทาน ฉีกขาดได้ยากกว่า
    • ต้องทำขั้นตอน pre-wet ก่อนใช้งาน
    • รองรับการทำ Stripping และ Reprobing ทำให้สามารถตรวจซ้ำบนเมมเบรนเดียวกันได้

   แม้เมมเบรน PVDF จะมีความทนทานและความสามารถในการยึดจับโปรตีนสูง แต่เมมเบรนชนิดนี้อาจเกิดสัญญาณพื้นหลังสูง (high background) ได้ หากขั้นตอนการบล็อกไม่สมบูรณ์ นอกจากนี้ เมมเบรน PVDF แบบมาตรฐานยังไม่เหมาะสำหรับงานตรวจแบบเรืองแสง (Fluorescent detection) เนื่องจากมักเกิดสัญญาณเรืองแสงรบกวน (autofluorescence) โดยเฉพาะในช่องสัญญาณที่มีความยาวคลื่นต่ำ เช่น UV, 488 และ 550 nm

    ทางเลือกที่เหมาะสมกว่าสำหรับงานที่ต้องใช้การตรวจเรืองแสงคือ Low Fluorescence PVDF Membrane ซึ่งถูกออกแบบเพื่อลดการเรืองแสงรบกวน และสามารถรองรับการตรวจจับได้ทั้งแบบ Colorimetric, Chemiluminescent และ Fluorescent detection

ภาพที่ 2 PVDF membrane

ตารางเปรียบเทียบระหว่างเมมเบรน Nirocellulose และ PVDF

หัวข้อ Nitrocellulose PVDF
ความทนทานทางกายภาพและทางเคมี เปราะบาง ฉีกขาดง่าย และไม่ทนต่อสารเคมี มีความเสถียรและทนทาน ฉีกขาดน้อยกว่า ทนต่อสารเคมี
การเตรียมก่อนใช้งาน ไม่ต้อง pre-wet Pre-wet ด้วยเมทานอลก่อนใช้งาน
ความสามารถในการจับกับโปรตีน (Binding capacity) ต่ำกว่า (80-100 µg/cm2) สูงกว่า (170-200 µg/cm2)
ความไวในการตรวจจับ (Sensitivity) ความไวต่ำกว่า ความไวสูงกว่าเนื่องจากความสามารถจับโปรตีนสูง
สัญญาณพื้นหลัง (Background) ต่ำกว่า สูงกว่า
การทำ Strip และ Reprobe ทำได้ยาก ทำได้ง่าย
วิธีการตรวจสัญญาณ (Detection) Colorimetric detection Chemiluminescent detection
 
Colorimetric detection
Chemiluminescent detection
Fluorescent detection (เลือกใช้ PVDF แบบ Low fluorescence)

เกณฑ์การเลือกเมมเบรน

  • ขนาดโปรตีน: โปรตีนขนาดใหญ่ต้องใช้เมมเบรนที่มีรูพรุนใหญ่ (0.45 µm) เพื่อให้ถ่ายโอนไปยังเมมเบรนได้มีประสิทธิภาพ ในขณะที่โปรตีนขนาดเล็กสามารถถ่ายโอนได้ดีผ่านเมมเบรนที่มีรูพรุนเล็กกว่า (0.1–0.2 µm)
  • ความชอบน้ำ/ไม่ชอบน้ำของโปรตีน: โปรตีนที่ไม่ชอบน้ำ (hydrophobic) จะยึดติดได้ดีบนเมมเบรนที่ไม่ชอบน้ำ เช่น PVDF ส่วนโปรตีนที่ชอบน้ำ (hydrophilic) จะเหมาะกับ Nitrocellulose
  • ความเข้ากันได้กับวิธีตรวจสัญญาณ: Chemiluminescence detection สามารถเลือกใช้เมมเบรนได้ทั้ง Nitrocellulose, PVDF หรือ Low fluorescence PVDF ในขณะที่ Fluorescent western blot ควรเลือกใช้เมมเบรน Low fluorescence PVDF
  • ปริมาณโปรตีน: สำหรับโปรตีนที่มีปริมาณน้อย ควรเลือกเมมเบรนที่มีความสามารถในการยึดจับสูง เช่น PVDF

รายละเอียดเพิ่มเติม: https://www.sigmaaldrich.com/US/en/products/protein-biology/protein-electrophoresis-and-western-blotting/transfer-membranes-and-kits
หรือติดต่อแผนก Technical Support e-mail: TAS@3nholding.com
หรือฝ่ายงาน Life Science Product โทร 02-274-8331

บทความโดย สุภิสรา ธนบัตร
Technical Application Specialist


X