เพิ่มประสิทธิภาพการปรับปรุงพันธุ์โคด้วย Axiom™ Bovine Genotyping Array

    Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array ภายใต้แบรนด์ Applied Biosystems™ เป็นไมโครอาร์เรย์ที่พัฒนาบนแพลตฟอร์ม Axiom™ Genotyping สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลพันธุกรรมในโค Bos taurus และ Bos indicus โดยถูกออกแบบให้รองรับงานด้านการยืนยันสายพันธุ์ (Parentage verification), การคัดเลือกทางพันธุกรรม (Genomic selection), การประเมินพันธุกรรมโคนม (Dairy evaluation), การตรวจคัดกรองโรคทางพันธุกรรม (genetic disease screening) รวมถึงการวิเคราะห์ CNV และลักษณะทางเศรษฐกิจที่มีความซับซ้อน นอกจากนี้ยังสามารถเลือกใช้งานได้ทั้งในรูปแบบ Axiom mini-96-well format และ Axiom 384HT format เพื่อความเหมาะสมตามปริมาณตัวอย่างและความต้องการของงานวิจัยหรือการปรับปรุงพันธุ์

ภาพที่ 1 Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array (mini-96-well and 384HT format)

ลักษณะเด่นของ Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array

• ความครอบคลุมของข้อมูลพันธุกรรมสูง
ประกอบด้วย SNPs มากกว่า 64,000 ตำแหน่ง ครอบคลุมจีโนมของโคทั้ง Bos taurus และ Bos indicus อย่างเหมาะสมสำหรับงานคัดเลือกและประเมินพันธุกรรม

• รองรับการวิเคราะห์ลักษณะด้อยทางพันธุกรรม (Recessive traits)
รวมชุด marker ที่เกี่ยวข้องกับยีนก่อโรคทางพันธุกรรมสำคัญ ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการจัดการสุขภาพและการคัดเลือกพันธุกรรม

• รองรับการตรวจวิเคราะห์ Copy Number Variation (CNV)
เพิ่ม probe ในบริเวณที่มีการเปลี่ยนแปลงจำนวนสำเนายีน เพื่อให้การประเมินผลของ CNV ต่อสุขภาพและลักษณะเศรษฐกิจมีความแม่นยำยิ่งขึ้น

• ผ่านการรับรองโดย Council on Dairy Cattle Breeding (CDCB)
ประกอบด้วย marker ที่ผ่านการยืนยันแล้วกว่า 44,887 ตำแหน่ง สำหรับใช้ประเมินพันธุกรรมโคนมและตรวจสอบสายพันธุ์ด้วยความเชื่อถือได้สูง

• รองรับการติดตามสายพันธุ์และสมรรถภาพการสืบพันธุ์
มี marker บนโครโมโซม Y และไมโทคอนเดรีย ช่วยตรวจสอบสายพันธุ์อย่างแม่นยำ และสนับสนุนการประเมินสมรรถภาพการสืบพันธุ์ของโค

ภาพที่ 2 การกระจายและความครอบคลุมของ marker บนจีโนมโคของชุด Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array

การครอบคลุมลักษณะทางพันธุกรรมที่สำคัญ

• ลักษณะสีขน (Coat color)
รองรับการตรวจยีนที่เกี่ยวข้อง เช่น MC1R และ PMEL17 เพื่อใช้ในการคัดเลือกสายพันธุ์และลักษณะภายนอก

• โรคทางพันธุกรรม (Genetic disorders)
ครอบคลุมยีนที่เกี่ยวข้องกับโรคสำคัญ อาทิ BLAD, DUMPS, Citrullinemia, และ Spinal muscular atrophy ช่วยลดความเสี่ยงและเพิ่มความปลอดภัยในการผสมพันธุ์

• ลักษณะการผลิตน้ำนม (Milk production traits)
รวม marker สำหรับยีนสำคัญ เช่น β-casein และ κ-casein ซึ่งมีบทบาทต่อปริมาณและคุณภาพน้ำนม

• ลักษณะทางกล้ามเนื้อและคุณภาพเนื้อ (Meat and muscle traits)
ตรวจยีนสำคัญ เช่น CAPN1 และ CAST ช่วยสนับสนุนการคัดเลือกโคเพื่อเพิ่มคุณภาพเนื้อและประสิทธิภาพการผลิต

ตารางที่ 1 ตัวอย่างลักษณะทางพันธุกรรมที่สำคัญที่มีให้วิเคราะห์บน Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array

    นอกจากนี้ ยังครอบคลุม marker สำหรับ haplotype เฉพาะสายพันธุ์ เช่น AH1 (Ayrshire), BH1–BH5 (Brown Swiss), HH1–HH5 (Holstein) และ JH1 (Jersey) ซึ่งมีความสำคัญต่อการประเมินลักษณะพันธุกรรมเฉพาะสายพันธุ์และลดความเสี่ยงของการสูญเสียตัวอ่อนในการผสมพันธุ์

    ด้วยความครอบคลุมของข้อมูลและความละเอียดระดับสูง Axiom™ Bovine Genotyping v3 Array จึงเป็นเครื่องมือสำคัญสำหรับนักวิจัยและผู้ปรับปรุงพันธุ์สัตว์ที่ต้องการข้อมูลพันธุกรรมที่เชื่อถือได้ เพื่อสนับสนุนการพัฒนาอุตสาหกรรมโคนมและโคเนื้ออย่างมีประสิทธิภาพในระยะยาว

ข้อมูลเพิ่มเติม: https://www.thermofisher.com/th/en/home/life-science/microarray-analysis/agrigenomics-solutions-microarrays-gbs/bovine-livestock.html
หรือติดต่อแผนก Technical Support e-mail: TAS@3nholding.com
หรือฝ่ายงาน Life Science Product โทร 02-274-8331

บทความโดย: สุมิตรา สุขพิทักษ์
ตำแหน่ง: Technical Application Specialist