Q: ทำไมจึงต้องมีบริการสังเคราะห์ยีน

A: - การสังเคราะห์ Genes และ DNA fragments มีราคาย่อมเยากว่าการทำ traditional cloning ทำให้ท่านประหยัดเงิน

- การสังเคราะห์ยีนใช้เวลาน้อยการการทำ traditional cloning ทำให้ท่านประหยัดเวลาในการทำงาน

- กำจัดขั้นตอนการออกแบบ primer ที่จำเพาะในการทำ traditional cloning เนื่องจากลำดับ DNA จะถูกสังเคราะห์ตามความต้องการ

- ท่านจะได้รับ DNA templates จากการสังเคราะห์ โดยไม่ต้องเก็บตัวอย่างจากธรรมชาติ

Q: Gene optimization คืออะไร และดีอย่างไร

A: การทำ Gene Optimization จะใช้ GeneOptimizer software การคำนวณ parameter เพื่อหา DNA sequence ที่เหมาะสมในการ encode protein ที่สนใจในสิ่งมีชีวิตใดสิ่งมีชีวิตหนึ่ง โดยการปรับ codon usage ของยีน ซึ่ง GeneOptimizer software จะประเมิน mRNA stability ด้วย parameter ที่หลากหลายในปัจจัยต่างๆ ไม่ว่าจะเป็น GC content, ribosomal binding sites, consensus และ cryptic splice sites, repeats และ secondary structures รวมถึงจำนวน stable mRNA molecules ที่จะนำไปสู่การเพิ่ม yields ของ protein

Q: บริการสังเคราะห์ยีนมีกี่แบบ อะไรบ้าง

A: บริการสังเคราะห์ยีนมี 2 แบบใหญ่ๆ ได้แก่

1. GeneArt String DNA fragment: เป็นบริการสังเคราะห์ชิ้น double strand DNA แบบ blunt end ที่ไม่มีความซับซ้อนของ DNA ตั้งแต่ขนาด 150bp – 3 Kb, ปริมาณ DNA ที่ได้รับจะอยู่ในรูป lyophilized การันตี yield > 200 ng

2. GeneArt Gene synthesis: เป็นบริการสังเคราะห์ double strand DNA แล้ว clone เข้า standard vector โดยมีปริมาณ 5 μg ในรูป lyophilized DNA สามารถสังเคราะห์ DNA ตั้งแต่ขนาด 100bp – 10 Kb และการันตีความถูกต้องการทำ sequencing

Q: หากท่านใช้บริการ Gene synthesis service ท่านจะได้รับอะไรบ้าง

A: GeneArt Gene Synthesis service สามารถระบุความต้องการสำหรับ gene optimization, การสังเคราะห์ DNA จะอยู่ในรูป lyophilized DNAในส่วนของ quality control documentation จะ online อยู่ใน Thermo Fisher Cloud 

Q: หากท่านสนใจจะใช้บริการ Gene synthesis service จะต้องเตรียมข้อมูลอะไรบ้าง

A: ในกรณีที่ท่านต้องการใช้บริการ GeneArt gene synthesis จะต้องมีการเตรียมข้อมูลดังนี้

- DNA หรือ amino acid sequence ของยีนที่สนใจ

- หากต้องการ optimize codon สามารถแจ้งชื่อสิ่งมีชีวิต (organism) เป็นชื่อวิทยาศาสตร์ที่ต้องการได้

- กรณีต้องการตัดชิ้น DNA สามาถแจ้งตำแหน่งและชนิดของ restriction enzyme ได้

- ผู้วิจัยสามารถออกแบบ motifs ต่างๆ ได้ตามความเหมาะสม เช่น Kozak sequence, stop codons เป็นต้น

- เลือกใช้ Expression vector จาก list ได้ด้วยการเรียกใช้ GeneArt subcloning service

รวบรวมคำถามโดย: ชุตินธร ช่วยวงศ์

ตำแหน่ง: Senior Technical Application Specialist for NGS and GeneArt Products